植物学

通过测序的基因分型可以揭示由网状池中的基因库中的复杂马赛克基因组

用于推断培养柑橘的系统核糖核苷酸的特拉西斯科工具。

与繁殖特征相结合的网状演化,限制了进一步的间隙重组,导致来自祖传群的大型基因组片段的混合马赛克。全基因组测序(WGS)数据是破译此类复杂基因组的强大工具,但仍然太昂贵可用于大群。这项工作的目的是在减少基因组复杂性文库中,开发一种方法来推断二倍体,三倍体和四倍体个体中的系统致细胞源结构。该方法适用于栽培 柑橘 基因库由涉及四个祖先的分类涉及四个祖先的进化, C. Maxima., C. Medica., C. micrantha.C. Reticulata..

工作流程图
用于识别四个祖先诊断标记的工作流程(C. Maxima., C. Medica., C. micrantha.C. Reticulata.来自GBS读取。

在43,598个开采的SNP中, 艾哈迈德 . 鉴定了一种覆盖全基因组的一组15,946个DSNP,其分布类似于基因序列的分布。该设定有效地推断出53分析的附加的系统核蛋白型,为常见的换乘模式提供了非常接近使用WGS数据建立的常见载体的图案。第一次揭示了21种栽培柑橘,包括佛灵,三倍体和四倍体酸橙的复杂核糖,包括佛灵,三倍体和四倍体酸橙。

在线提供的管道,有效推断二倍体,三倍体和四倍体柑橘的系统核发科学结构。它对任何生殖行为导致大型基因组片段的特异性马赛克的物种都很有用。它还可以用于第一代的三代间隙育种方案。